挑戦期間は自由に設定できるのでしょうか？

設定できます。
ただし、クラウドファンディングは、単にプロジェクトを掲載すれば自然に支援が集まる仕組みではありません。その為、期限を区切って集中的に宣伝することをお勧めします。なお、当法人では凡そ2ヶ月を想定しています。